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JOURNAL PAPERS

Dartora, A.; Oliveira, L. F.; Segmentação por Blocos em Imagens Médicas Utilizando Extratores de Características. Journal of Health Informatics. , v.8, p.257 – 263, 2016. (in portuguese) [pdf]

Souza, J. A. M.; Tieppo, E.; Magnani, G.S.M.; Alves, L. M. C.; Cardoso, R.L.A.; Cruz, L. M.; Oliveira, L. F.; et al., Draft genome sequence of the nitrogen-fixing symbiotic bacterium Bradyrhizobium elkanii 587. Journal of Bacteriology (Print), v.194, p.3547 – 3548, 2012.

Perini, A. P.; Oliveira, L. F.; Siqueira, R. B.; Machado, H. R.; Carneiro, A. A. O., Neuronavegador Cirúrgico Guiado por Imagens de Ressonância Magnética pré-operatória, baseado num transdutor de Posição Magnético. Revista Brasileira de Engenharia Biomédica. , v.25, p.89 – 100, 2009.

Gomes, V. V.; Vortmann, C. H.; Giusti, F.; Oliveira, L. F., Algoritmo Computacional para Volumetria de Estruturas Cerebrais em Imagens Médicas. Logos (Canoas). , v.1, p.227 – 238, 2008.

Padua, R. D. S.; Oliveira, L. F.; Azevedo-Marques, P. M.; De Groote, J. J.; Castro, A. A.; Wichert-Ana, L.; Simoes, M. V., Auxílio à Detecção de Anormalidade Perfusional Miocárdica Utilizando Atlas de SPECT e Registro de Imagens: resultados preliminares. Radiologia Brasileira. , v.41, p.397 – 402, 2008.

Milani, C. R.; Rediess, F. K.; Vortmann, C. H.; Patzer, G. P.; Mattos, M. H.; Oliveira, L. F., Estudo do Desenvolvimento Multiplataforma de uma Ferramenta para Processamento e Visualização Interativa de Imagens de Ressonância Magnética. Logos (Canoas). , v.1, p.157 – 165, 2008.

Wichert-Ana, L.; Azevedo-Marques, P. M.; Oliveira, L. F.; Fernandes, R.M.F.; Velasco, T.R.; Santos, A.C.; Araújo, D.; Kato, M.; Bianchin, M.M.; Sakamoto, A.C., Ictal technetium-99 m ethyl cysteinate dimer single-photon emission tomographic findings in epileptic patients with polymicrogyria syndromes: A Subtraction of ictal¿interictal SPECT coregistered to MRI study. European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging (Print)., v.35, p.1159 – 1170, 2008.

Wichert-Ana, L.; Oliveira, L. F.; Azevedo-Marques, P. M.; Terra-Bustamante, V. C.; Fernandes, R. M. F.; Santos, A. C.; Araujo, W. M.; Bianchin, M. M.; Simoes, M. V.; Sakamoto, A. C., Interictal hyperemia correlates with epileptogenicity in polymicrogyric cortex. Epilepsy Research., v.79, p.39 – 48, 2008.

Simoes, M. V.; Oliveira, L. F.; Hiss, F.C.; Figueiredo, A.B.; Pintya, A. O.; Maciel, B.C.; Marin-Neto, J.A., Caracterização do Aneurisma Apical da Cardiopatia Chagásica Crônica Mediante Uso de Corregistro de Imagens Cintilográficas. Arquivos Brasileiros de Cardiologia (Impresso)., v.89, p.119 – 121, 2007.

Milani, C.R.; Cavalheiro, G. G. H.; Oliveira, L. F., Ferramenta multithread de visualização interativa para auxílio na detecção do foco epileptogênico. Hífen (Uruguaiana). , v.31, p.64 – 70, 2007.

Morais, S.L.; Derenusson, G.N.; Pinto. J.P.; Hounie, A. G.; Dursun, S.M.; Wichert-Ana, L.; Kato, M.; Oliveira, L. F.; Azevedo-Marques, P. M.; Sakamoto, A. C.; Hallak, J.E.C., Neurobiological Substrates of Electroconvulsive Therapy for Tourette Syndrome: A Serial SISCOM Study. The Journal of Electroconvulsive Therapy., v.23, p.278 – 280, 2007.

Wichert-Ana, L.; Ferruzi, E. H.; Velasco, T. R.; Bianchini, M. M.; Araujo, W. M.; Santos, A. C.; Azevedo-Marques, P. M.; Oliveira, L. F.; Simoes, M. V.; Sakamoto, A. C., Sphenoid sinus bleeding during generalized seizure: A rare SISCOM finding mimicking skull base tumor. Clinical Nuclear Medicine., v.32, p.45 – 46, 2007.

Wichert-Ana, L.; Ferruzzi, E. H.; Alexandre, Jr. V.; Velasco, T. R.; Bianchin, M. M.; Terra-Bustamante, V. C.; Kato, M.; Santos, A. C.; Azevedo-Marques, P. M.; Oliveira, L. F.; Sakamoto, A. C., Epistaxis During Generalized Seizure Leading to an Atypical Ictal SPECT Finding at the Skull Base. Journal of Epilepsy and Clinical Neurophysiology. , v.12, p.225 – 227, 2006.

Pontes-Neto, O. M.; Wichert-Ana, L.; Terra-Bustamante, V. C.; Velasco, T. R.; Azevedo-Marques, P. M.; Oliveira, L. F.; Santos, A. C.; Sakamoto, A. C., Pontine activation during focal status epilepticus secondary to harmatoma of the floor of the fourth ventricle. Epilepsy Research., v.68, p.265 – 267, 2006.

Martins, E. R. S.; Azevedo-Marques, P. M.; Oliveira, L. F.; Pereira Junior, R. R.; Trad, C. S., Caracterização de Lesões Intersticiais de Pulmão em Radiograma de Tórax Utilizando Análise Local de Textura. Radiologia Brasileira. , v.38, p.421 – 426, 2005.

Wichert-Ana, L.; Santos, A. C.; Azevedo-Marques, P. M.; Oliveira, L. F.; Simoes, M. V.; Guarnieri. R.; Kato, M.; ARAUJO, W. M.; ARAUJO, D.; Sakamoto, A. C., SPECT and PET Imaging in Epilepsy: Principles and Clinical Applications. Journal of Epilepsy and Clinical Neurophysiology. , v.11, p.19 – 30, 2005.

Crippa, J.A.; Zuardi, A.; Garrido, G.E.; Wichert-Ana, L.; Guarnieri. R.; Oliveira, L. F.; Azevedo-Marques, P. M.; Hallak, J.E.C.; Mc Guire, P.K.; Busatto, G.F., Effects of Cannabidiol (CBD) on Regional Cerebral Blood. Neuropsychopharmacology (New York, N.Y.).,  v.29, p.417 – 426, 2004.

Rodrigues, L. C.; Oliveira, L. F.; Oliveira, M. C.; Azevedo-Marques, P. M., Ferramenta de Auxílio ao Diagnóstico em Neurologia. Revista UNORP. , v.4, p.23 – 27, 2003.

Azevedo-Marques, P. M.; Oliveira, M. C.; Oliveira, L. F.; Rodrigues, L. C.; Caetano, G. F.; Araujo, D.; Wichert-Ana, L. NeuroCAD – uma ferramenta open-source para auxílio ao diagnóstico em neurologia. Revista Brasileira de Engenharia Biomédica. , v.19, p.73 – 82, 2003.

Oliveira, L. F.; Azevedo-Marques, P. M., Coregistration of brain single-positron emission computed tomography and magnetic resonance images using anatomical features. Journal of Digital Imaging., v.13, p.196 – 199, 2000.

Gualeve, J. A. F.; Oliveira, L. F., Visualização do Funcionamento de um Computador Básico. Revista Unimar. , v. VI, p.113 – 117, 1997.

 

BOOK CHAPTERS

Patzer, G. P.; Nascimento, M. Z.; Oliveira, L. F.; Simões, M. V., Alinhamento Automático de Imagens de Cintilografia Miocárdica Através da Combinação de Técnicas de Processamento de Imagens In: IFMBE Proceedings.1 ed.Berlin : Springer Berlin Heidelberg, v.33, p. 523-526, 2013.

Andersson, V. O.; Oliveira, L.F., Auxílio ao Diagnóstico do Glaucoma Utilizando Processamento de Imagens In: Avanços em Visão Computacional.1 ed.Curitiba : Omnipax, p. 85-98, 2012.

 

CONFERENCE PAPERS

Dartora, A.; Oliveira, L. F., Segmentação por Blocos em Imagens Médicas Utilizando Extratores de Características In: Congresso Brasileiro de Informáticas em Saúde, 2016, Goiânia.  Suplemento do Journal of Health Informatics – XV Congresso Brasileiro de Informática em Saúde – CBIS 2016. ,  v.8. p.257 – 263, 2016.

Bagesteiro, L.D.; Oliveira, L.F.; WEINGAERTNER, D., Blockwise Classification of Lung Patterns in Unsegmented CT Images In: 2015 IEEE 28th International Symposium on ComputerBased Medical Systems (CBMS), Sao Carlos. 2015 IEEE 28th International Symposium on Computer-Based Medical Systems., p.177 – 182, 2015.

Bordignon, L. A.; Oliveira, L. F., Classificação Automática de Amostras de Sementes Utilizando Visão Computacional In: Congresso Brasileiro de Agroinformática, 2015, Ponta Grossa.   X Congresso Brasileiro de Agroinformática (SBIAGRO)., 2015.

Patzer, G.P.; Nascimento, M. Z.; Simoes, M. V.; Alves, J. H.; Wichert-Ana, L.; Azevedo-Marques, P. M.; Oliveira, L. F., The Automatic Polar Map Creation for Myocardial Perfusion SPECT Analysis Using Image Registration Combined with Feature Extraction In: XXXV Congresso da Sociedade Brasileira de Computação (CSBC 2015), 2015, Recife.   XV Workshop de Informática Médica (WIM). , 2015.

Almeida, A. G. D.; Machado, E. L. S.; Fujii, S.Y.; Souza, J. P. V.; Steffens, M.B.R.; Oliveira, L. F., Reescrita de código e utilização de Paralelismo de Dados para a busca de Small RNAs (sRNAs) In: XXXIII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação – CSBC 2013, 2013, Maceió. VII BreSci – Brazilian e-Science Workshop. , 2013.

Oliveira, L. F.; Narloch, A.L.M.; Joanico, W. R.; Hass, I., Análise Automatizada de Géis de Eletroforese Unidimensionais (AAGEU). Etapa 1: Detecção das Colunas e do Marcador In: Workshop de Visão Computacional, 2012, Goiânia. VIII Workshop de Visão Computacional. , 2012.

Oliveira, L. F.; Narloch, A.L.M.; Kist, D. M.; Soares Filho, M. P.; Meneghello, G. E.; Cavalheiro, G. G. H.; Tillman, M.A.A., Extração de Características de Forma Utilizando Matriz de Co-ocorrência e Atributos de Haralick In: Workshop de Visão Computacional, 2012, Goiânia. VIII Workshop de Visão Computacional. Goiânia: , 2012.

Kist, D. M.; Narloch, A.L.M.; Rodrigues, L.; Menegaz, W.; Rosa, T.D.; Meneghello, G. E.; Oliveira, L. F.; Tillman, M.A.A.; Cavalheiro, G. G. H., Computação Visual na Identificação de Sementes Utilizando Extração de Características de Forma In: Congresso Brasileiro de Agroinformática, 2011, Bento Gonçalves. VIII Congresso Brasileiro de Agroinformática. , 2011.

Fujii, S.Y.; Wichert-Ana, L.; Azevedo-Marques, P. M.; Oliveira, L. F., Estudo Comparativo da Utilização de Filtros de Suavização para Reconstrução 3D de Superfícies In: Workshop de Visão Computacional (WVC), 2011, Curitiba. Workshop de Visão Computacional (WVC 2011). v.1. p.302 – 307, 2011.

Andersson, V. O.; Oliveira, L. F., Software para Auxílio no Diagnóstico do Glaucoma In: Workshop de Visão Computacional (WVC), 2011, Curitiba. Workshop de Visão Computacional (WVC 2011)., v.1. p.266 – 271, 2011.

Patzer, G.P.; Nascimento, M. Z.; Oliveira, L. F.; Simoes, M.V., Algoritmo de Alinhamento Automático de Imagens de Cintilografia Miocárdica In: CBIS – Congresso Brasileiro de Informática e Saúde, 2010, Porto de Galinhas.
CBIS 2010 – XII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde. São Paulo: SBIS – Sociedade Brasileira de Informática em Saúde, 2010.

Oliveira, L. F.; Kist, D. M.; Cavalheiro, G. G. H.; Meneghello, G. E.; Tillman, M.A.A., Segmentação de Imagens com Fundo Azul Utilizando a Mutliplicação dos Canais HSV In: Workshop de Visão Computacional, 2010, Presidente Prudente. VI Workshop de Visão Computacional. , 2010. v.1. p.1 – 6

Oliveira, L. F.; Coimbra, T. C.; Bandeira, R. L.; Medeiros, R. S.; Patzer, G.P.; Azevedo-Marques, P. M., Segmentação de Imagens de Pulmão Adquiridas através de Tomografia Computadorizada In: CBIS – Congresso Brasileiro de Informática e Saúde, 2010.  CBIS 2010 – XII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde. São Paulo: SBIS – Sociedade Brasileira de Informática em Saúde, 2010.

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Oliveira, L. F.; Wichert-Ana, L.; Sakamoto, A. C.; Azevedo-Marques, P. M., Brain Registration and Subtraction – Improved Localization for SPECT Analysis (B.R.A.S.I.L.): A computer-aided diagnosis in epilepsy tool kit In: ACM Symposium on Applied Computing (SAC), 2008, Fortaleza. PROCEEDINGS OF THE 2008 ACM SYMPOSIUM ON APPLIED COMPUTING. New York: The Association for Computing Machinery, Inc., v.2. p.1390 – 1394, 2008.

Milani, C.R.; Oliveira, L. F.; Cavalheiro, G. G. H., Desenvolvimento multithread do Epileptogenics Foci Visualizator – EFV In: Escola Regional de Alto Desempenho, 2008, Santa Cruz do Sul.   8a. Escola Regional de Alto Desempenho – ERAD 2008., v.1. p.221 – 224, 2008.

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Azevedo-Marques, P. M.; Oliveira, L. F.; Wichert-Ana, L.; Sakamoto, A. C., B.R.A.S.I.L. Software: Towards applyng computer-aided diagnosis in epilepsy clinical routine In: XX Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, São Pedro. XX Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica. , 2006.

Oliveira, L. F.; Azevedo-Marques, P. M.; Wichert-Ana, L.; Sakamoto, A. C., Support software for clinical diagnosis in epilepsy: B.R.A.S.I.L. brain registration and subtraction improved localization for SPECT analysis In: Computer Assisted Radiology and Surgery – CARS2006, Osaka.  International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery. Heidelberg, Germany: Springer, v.1. p.386 – 388, 2006.

Martins, E. R. S.; Azevedo-Marques, P. M.; Oliveira, L. F.; Pereira Junior, R. R.; Barros AD; Trad, C. S.; Martinez, J. A. B., Caracterização de anormalidades em radiografia frontal de tórax utilizando análise estatística de textura In: Congresso Latino Americano de Engenharia Biomédica – CLAEB, 2004, João Pessoa.  IFMBE Pro. 2004 – III CLAEB. ,  v.5. p.1367 – 1370, 2004.

Wichert-Ana, L.; Terra-Bustamente, V. C.; Santos, A. C.; Araujo, D.; Oliveira, L. F.; Kato, M.; Araujo, W. M.; Simoes, M. V.; Azevedo-Marques, P. M.; Sakamoto, A. C., Software de Corregistro entre RM e SPECT Localiza a Zona Epileptogênica em uma Paciente com Síndrome do Nevo Epidérmico In: Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2004, Ribeirão Preto. Anais do IX Congresso Brasileiro de Informática em Saúde. ,  p.1215 – 1216, 2004.

Pontes-Neto, O. M.; Wichert-Ana, L.; Terra-Bustamante, V. C.; Santos, A. C.; Araujo, D.; Oliveira, L. F.; Kato, M.; Simoes, M. V.; Azevedo-Marques, P. M.; Sakamoto, A. C., Software de Corregistro entre RM e SPECT Revela Hamartoma do 4º. Ventrículo como Causa de Status Epilepticus Clinicamente Intratável In: CBIS’2004 – IX Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2004, Ribeirão Preto. Anais do IX Congresso Brasileiro de Informática em Saúde. ,  p.1219 – 1220, 2004.

Rodrigues, L. C.; Oliveira, M. C.; Oliveira, L. F.; Azevedo-Marques, P. M., Ferramenta de Auxílio ao diagnóstico em Neurologia In: Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2002, Natal. CBIS2002 – VIII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde. , 2002.

Oliveira, M. C.; Oliveira, L. F.; Rodrigues, L. C.; Azevedo-Marques, P. M., NeuroCAD: Ferramenta de Auxílio ao Diagnóstico em Neurologia In: Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, 2002, São José dos Campos.
XVIII Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica. ,  v.5/5. p.293 – 296, 2002.

Oliveira, L. F.; Azevedo-Marques, P. M., Algoritmo para co-registro de imagens de SPECT e Ressonância Magnética In: CBEB – Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, 2000, Florianópolis. Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica., 2000.

Oliveira, L. F.; Rodrigues, L. C.; Oliveira, M. C.; Azevedo-Marques, P. M., Diagnóstico em Epilepsia Auxiliado por Computador In: CBIS – Congresso Brasileiro de Informática e Saúde, 2000, São Paulo.  Diagnóstico em Epilepsia Auxiliado por Computador. , 2000.

Oliveira, L. F.; Gualeve, J. A. F., Visualização do Funcionamento de um Computador Básico In: 1o. Simpósio de Iniciação Científica, 1997, Marília.  1o. Simpósio de Iniciação Científica – Marília – SP. Marília – SP: , v.1. p.7 – 7, 1997.

 

MSC DISSERTATIONS

Jeovane Honório Alves. A Lung Cancer Detection Approach Based on Shape Index and Curvedness Superpixel Candidate Selection.  UFPR, PPGEE, 2016. [pdf]

Luiz Alberto Bordignon. Identificação de Sementes Utilizando Visão Computacional. UFPR, PPGEE, 2015. [pdf]

Luiza Dri Bagesteiro. Classificação de Padrões Radiológicos por Bloco de Imagens não Segmentadas de Tomografia Computadorizada.  UFPR, PPGINF (coadvisor), 2015. [pdf]

Sérgio Yoshimitsu Fujii. Utilização de Técnicas de Otimização de Desempenho em Bioinformática. Estudo de Caso: sRNAScanner. UFPR, Bioinformática, 2012. [pdf]

William Rodrigo Joanico. Análise Automatizada em Géis de Eletroforese Unidimensionais utilizando Técnicas de Processamento de Imagens – AAGEU. UFPR, Bioinformática (coadvisor), 2012.

Gabriel Paniz Patzer. Método Automático para Criação de Mapas Polares Baseado em Alinhamento de Imagens.  UFABC, Engenharia da Informação (coadvisor), 2011. [pdf]

Eduardo Tieppo. Montagem e Análise da Bactéria Diazotrófica Bradyrhizobium elkanii 587 utilizando leituras curtas de DNA. UFPR, Bioinformática (coadvisor), 2011.